Opbevaring af PCB kræver omhyggelig kontrol med miljøforhold, da dette er en kernefaktor, der påvirker levetid og pålidelighed. PCB er mest sårbare over for fugt, høje temperaturer og ætsende gasser i luften. Derfor bør det ideelle opbevaringsmiljø være tørt, ved stuetemperatur og med stabil ventilation. Luftfugtighed anbefales generelt at blive kontrolleret mellem 40% og 60%. Hvis den omgivende luftfugtighed er for høj, vil PCB let absorbere fugt, hvilket potentielt forårsager "brætsprængning" eller delaminering under efterfølgende reflowlodning. Langvarig-eksponering for luft vil også få loddepuderne til gradvist at oxidere, hvilket påvirker loddeevnen. Til høj-præcisionsplader eller dem, der opbevares i lange perioder, placeres de normalt i et affugtningsskab eller vakuum-forseglet fugtsikker-emballage sammen med tørremidler for at reducere fugtpåvirkningen.
Pakning og placering er også vigtig. Forskellige stadier af PCB-udvikling kræver forskellige niveauer af beskyttelse. Umonterede nøgne brædder er generelt forseglet i anti-statiske poser for at forhindre opbygning af statisk elektricitet og metaloxidation. For PCBA'er med monterede komponenter er der behov for yderligere støddæmpningsmateriale for at forhindre kollisionsskader under transport eller håndtering. Kraftig stabling bør undgås under opbevaring, især for flerlagsplader eller store-brædder, da langvarig belastning kan føre til let vridning eller endda ændringer i indre strukturelle belastninger. I opmagasinering anbefales direkte kontakt med jorden eller nærhed til vægge ikke for at minimere påvirkningen af fugttilbagestrømning og temperaturudsving.
For langtidsopbevaring eller lagerstyring skal periodiske inspektioner og udløbsdatokontrol også overvejes. PCB er ikke produkter, der kan opbevares i det uendelige. Selv i gode miljøer vil overfladebehandlingslag (såsom OSP, immersionsguld og loddebelægning) langsomt ældes over tid. Derfor indstilles lagercyklusser normalt, såsom gen-inspektion hver 3. eller 6. måned. Gen-inspektion omfatter kontrol for oxidation, ændringer i pudens farve og integriteten af fugtsikker-emballage. Hvis der konstateres let oxidation, kan loddeevnen genoprettes gennem professionel rengøring eller oparbejdning.
